阿仑膦酸钠是阿仑膦酸的钠盐，第二代双膦酸酯，并用骨抗骨吸收活性焦磷酸合成类似物。阿仑膦酸钠合并抑制香叶基转移酶（法呢基焦磷酸合成酶）的活性，这是一种参与萜类生物合成的酶。抑制这种酶会阻止类异戊二烯脂质（FPP 和GGPP）的生物合成。
阿仑膦酸钠作用机制：
阿仑膦酸钠与骨羟基磷灰石标签结合。骨吸收导致局部酸化，释放阿仑膦酸，通过液相内吞作用进入破骨细胞。内吞囊泡被酸化，将阿仑膦酸钠释放到破骨细胞的细胞质中，在那里它们诱导细胞凋亡。破骨细胞的抑制导致骨吸收减少，这通过尿钙、脱氧吡啶啉和 I 型胶原标签的交联 N-端肽酶减少来显示。