作为第三代主体超分子化合物，杯芳烃具有独特的空穴结构，与冠醚和环糊精相比具有如下特点：
1.它是一类合成的低聚物，它的空穴结构大小的调节具有较大的自由度；
2.通过控制不同反应条件及引入适当的取代基，可固定所有需要的构象；
3.杯芳烃的衍生化反应，不仅在杯芳烃下缘的酚羟基、上缘的苯环对位，而且连接苯环单元的亚甲基都能进行各种选择性功能化，这不仅能改善杯芳烃自身水溶性差的不足，而且还可以改善其分子络合能力和模拟酶活力；
4.杯芳烃的热稳定性及化学稳定性好，可溶性虽较差，但通过衍生化后，某些衍生物具有很好的溶解性；
5.杯芳烃能与离子和中性分子形成主一客体包结物，这是集冠醚和环糊精两者之长；
6.杯芳烃的合成较为简单，可望获得较为廉价的产品，事实上现在已有多种杯芳烃商品化。