低聚果糖也称为FOS，是在某些植物的根中发现的略带甜味的碳水化合物。它具有与菊粉相似的某些有益特性，在这两种天然益生元中，FOS最甜，分子链最短。它被归类为纤维是因为它通过消化道而没有被代谢直到到达结肠。与纤维素纤维（麸等）不同，它是可溶性纤维，在许多蔬菜中都可以找到它。它的味道很好，甜度约为糖的一半。
低聚果糖是植物糖的链。它们取自芦笋，洋姜和大豆，或在实验室中生产。人们用这些糖做药，低聚果糖常被口用于便秘，有些人将它们用于减肥，预防旅行者的腹泻，治疗高胆固醇和骨质疏松症。但是，用于支持这些其他用途的科学研究有限。低聚果糖也被用作益生元。不要混淆益生菌和益生元，它们是活的生物，例如乳酸杆菌，双歧杆菌和酿酒酵母，对您的健康有益。益生元可作为这些益生菌的食物。人们有时会通过口摄入益生菌和益生菌，以增加肠道中的益生菌数量。